Criblage à haut débit

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L’activité de criblage à haut débit (High Throughput Screening, HTS) est essentielle au processus de découverte de nouveaux médicaments. Il consiste à sélectionner parmi des milliers de molécules celles qui pourraient avoir un usage pharmaceutique. Pour ce faire, de grandes bibliothèques de composés repositionnables sont testées sur un modèle biologique présentant une cible thérapeutique spécifique.

Forte de plus de 15 ans d’expertise dans le criblage de modèle biologique pertinents de maladies rares et ultra rares (cellules immortalisées et dérivés d’hIPS), la plateforme évalue la faisabilité, conseille et oriente les équipes de recherche dans le développement de leurs projets, de la miniaturisation de l’essais cellulaire en microplaque (96-384) jusqu’au choix d’un biomarqueur quantifiable à haut débit.

Lorsque le test cellulaire est suffisamment robuste, elle réalise la campagne de criblage primaire à une ou plusieurs doses en mono/quadruplicats, les retests et l’évaluation des EC/IC50 sur des librairies de molécules repositionnables personnalisées.

		METHODES DE QUANTIFICATIONS DE BIOMARQUEURS DISPONIBLES
HCS		Quantification de proteines membranaires
		Quantification de proteines nucléaires
		Translocation de proteines
		Colocalisation de proteines
HTS		Tests biochimiques variés (fluorescence ; luminescence)
		Quantification de proteines (Alpha Screen ; Alpha LISA ; HTFR)
		Quantification de test luciferase (Surexpression…)
		Quantification de marqueurs en absorbance

HCS : High Content Screening

En complément de cette activité, la plateforme mène des programmes de R&D permettant le développement de nouveaux essais biochimiques et moléculaires mais aussi de nouveaux outils cellulaires facilitant la quantification de biomarqueurs spécifiques.

Équipe

Johana Tournois

Resp. de plateforme (CECS)

Johana a rejoint I-Stem en 2006 et est responsable de la plateforme de criblage depuis 2016. Elle est spécialisée en robotique, data management et miniaturisation.

Amandine Thibaudeau

Ingénieure Plateforme (CECS)

Amandine a rejoint la plateforme fin 2022 afin de renforcer l’équipe de Criblage. Amandine a un Master Genie Cellulaire à L’université de Poitiers.

Yanis Genevois

Apprenti Technicien plateforme (CECS)

Collaborations

Renata Santos

IPNP, INSERM UMRS 1622, France

ANR targetBD : Approche pharmacologique des troubles bipolaires résistants au lithium.

Programmes Myopharm

(AFM-Téléthon) Production des ressources biologiques

– INSERM, Centre de Recherche en Myologie, Sorbonne Université, UMRS974, INSERM, Institut de Myologie-Faculté de Médecine de la Pitié Salpêtrière, Antoine Muchir
– CNRS UMR 5310 – INSERM U1217, Institut NeuroMyoGène, Université de Lyon, Arnaud Jacquier, Laurent Shaeffer
– INSERM U955 IMRB UPEC, Créteil, Frederic Relaix
– INSERM U1251, Marseille Medical Genetics, Valérie Delague

Publications

Identification of signaling pathways modifying human dopaminergic neuron development using a pluripotent stem cell-based high-throughput screening automated system: purinergic pathways as a proof-of-principle.

01 janvier 2023

Boissart Claire,

Lasbareilles Marie,

Tournois Johana,

Chatrousse Laure,

Poullion Thifaine,

Benchoua Alexandra,

Frontiers in pharmacology

Contribution of Human Pluripotent Stem Cell-Based Models to Drug Discovery for Neurological Disorders.

24 novembre 2021

Benchoua Alexandra,

Lasbareilles Marie,

Tournois Johana,

Cells

Rescuing compounds for Lesch-Nyhan disease identified using stem cell-based phenotypic screening.

27 février 2020

Ruillier Valentin,

Tournois Johana,

Boissart Claire,

Lasbareilles Marie,

Mahé Gurvan,

Chatrousse Laure,

Cailleret Michel,

Peschanski Marc,

Benchoua Alexandra,

JCI insight

VOIR TOUTES LES PUBLICATIONS

Agilent

Bravo-Benchcel

Automate de pipetage moyen débit associé à une station de stockage de microplaque, utilisé pour la mise au point des premières étapes de l’Assay development.

Agilent

Biocel 1800

Plateforme de criblage haut débit de l’institut permettant de réaliser le compound management et les criblages primaires (2006 AFM_Inserm_Genopole)

Thermo, Biotek

Plateforme de fixation et d’immuno-marquage

Utilisée pour réaliser à haut débit les marquages lors des criblages en High Content Screening (HCS) (2018 ou 2019)

BMG Labtech

Clariostar

Lecteur de microplaque HTS multimodes permettant la quantification de marqueurs en luminescence, fluorescence, TR-FRET, Alphascreen, Alphalisa, HTRF et Absorbance. (2013 genopole)

Molecular device

CX7 Cellomics et Image Express (Lecteurs HCS)

Microscope automatisé permettant de quantifier par fluorescence avec des objectifs allant du 5X jusqu’au 63X des biomarqueurs par immunofluorescence.

Thermo Fisher Scientific

Quantstudio 12k et 7k

Appareils de PCR en temps réel permettant de quantifier l’expression de gènes cibles en format 96 ou 384 puits (plateforme NGS)