Biologie Cellulaire

Le contrôle de la qualité est un facteur crucial et déterminant pour l’utilisation appropriée des cellules souches pluripotentes humaines et de leurs dérivés. A I-Stem, nous portons une vigilance particulière à ce domaine d’investigations car des anomalies cellulaires non détectées peuvent entraîner des erreurs majeures dans la modélisation pathologique et la pharmacologie, ou introduire des facteurs de risque sévères dans le cadre d’une thérapie cellulaire. C’est pourquoi notre équipe prend en charge la vérification systématique et régulière de l’ensemble des cellules générées dans l’Institut.

Le caryotypage est utilisé pour détecter des anomalies chromosomiques de l’ordre de 5 à 10 Mb (mégabases). Cette approche permet d’identifier aussi bien des anomalies de structure équilibrées, telles que les translocations réciproques, que des anomalies du nombre de chromosomes, comme les trisomies ou les monosomies. À cette fin, nous mettons en œuvre des techniques de cytogénétique conventionnelle, notamment du G ou R-banding, ainsi que la technique de multicolor Fluorescence In Situ Hybridization (mFISH), permettant une caractérisation précise du génome cellulaire.

Afin de renforcer le suivi de l’intégrité génomique des cellules, la plateforme assure une veille technologique active et évalue régulièrement de nouvelles méthodes de détection. Grâce à notre collaboration avec la société StemGenomics (Montpellier, France), nous disposons d’un test de détection très rapide des anomalies génétiques les plus couramment acquises par les cellules pluripotentes. Cet outil constitue un contrôle qualité essentiel aux étapes les plus sensibles, telles que la création de banques cellulaires à grande échelle par la Plateforme de Bioproduction ou encore les procédures d’édition du génome par la technologie CRISPR/Cas9, garantissant ainsi l’intégrité des cellules utilisées.

Au cours des dernières années, l’équipe a développé une expertise reconnue dans ces domaines. Parmi les projets que nous avons menés figuraient notamment l’exploration des mécanismes d’échappement au système immunitaire (« cellules fantômes »), en collaboration avec l’équipe de Thierry Heidmann, la société Viroxis et le CR2TI de Nantes, ainsi que des travaux réalisés dans le cadre du programme MyoPharm. Dans ce programme, I-Stem a collaboré avec plusieurs équipes de recherche françaises autour du développement de nouvelles approches thérapeutiques pour des maladies neuromusculaires ultra-rares.

La plateforme met également son expertise au service des équipes académiques et industrielles en proposant des prestations de contrôle génétique et cytogénétique, incluant le caryotypage par G/R-banding et mFISH, ainsi que des analyses par puces SNP permettant la détection d’anomalies chromosomiques à haute résolution.

ANR AAPG 2021 – PRCE: Ghosting The Cells (GTC):

Projet de recherche visant à développer des cellules « fantômes » capables de préserver les mécanismes de présentation des antigènes du CMH/HLA tout en induisant une tolérance immunitaire grâce à l’expression membranaire d’une molécule immunosuppressive dérivée d’un rétrovirus.