Pharmacologie des dystrophies musculaires

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Pharmacologie des dystrophies musculaires

L’équipe s’intéresse à l’utilisation des cellules souches pluripotentes pour comprendre et traiter les maladies génétiques rares. Nous nous concentrons principalement sur le développement d’approches de repositionnement de médicaments. Nos travaux se divisent en trois axes : la modélisation pathologique, le criblage pharmacologique à haut débit et le développement d’approches innovantes basé sur l’intelligence artificielle.

Rationnel :

L’un des principaux avantages des cellules souches pluripotentes est de permettre la génération d’un nombre potentiellement illimité de types cellulaires compatibles avec des applications pharmacologiques. Bien que ciblant différentes maladies (HGPS, LGMD et GSD III), notre équipe développe une démarche expérimentale commune:

  • Identifier de nouveaux mécanismes moléculaires et biomarqueurs
  • Développer des approches de repositionnement de médicaments ciblant des phénotypes pathologiques.
  • Développer des approches pharmacologiques ciblant l’homéostasie des protéines.
  • Identifier des candidats médicaments par criblage à haut débit.

 

Hutchinson Gilford progeria syndrome (HGPS):

Limb Girdle Muscular Dystrophies (LGMDs):

Glycogen storage diseases (GSD):

 

Nos recherches ont pour but de développer des approches pharmacologiques innovantes pour le traitement de la HGPS, une maladie congénitale rare caractérisée par un vieillissement accéléré (voir Lo Cicero et al, Ageing Res Rev. 2015, Guilbert SM et al, Methods 2021).

En 2010, en collaboration avec le Dr Nicolas Lévy, l’équipe d’I-Stem a été pionnière dans la génération de plusieurs lignées de cellules iPS portant la mutation C1804T du gène LMNA à l’origine de cette maladie. De 2010 à 2018, notre groupe a démontré avec succès qu’il était possible d’utiliser les dérivés de cellules iPS pour reproduire les caractéristiques clés du vieillissement prématuré dans les tissus osseux (Blondel S 2014 Stem Cells Transl Med. 2014 : Lo Cicero A, Sci Rep 2016 Retinoic), la peau (Lo Cicero et al Sci Rep 2018) et les tissus vasculaires (Ribas J et al Small 2017 ; Pitrez PR et al ACS Biomater Sci Eng. 2018). Nous avons également identifié de nouveaux mécanismes moléculaires de la HGPS, comme le rôle de miR-9 dans la régulation de l’expression de la progerine dans les neurones (Nissan X et al., Cell Reports, 2012).

Au cours de cette période, nous avons également identifié plusieurs nouveaux candidats médicaments, modulant l’épissage alternatif de LMNA par la metformine (Egesipe AL, NPJ Aging Mech Dis. 2016) et du MG132 (Harhouri K, et al EMBO Mol Med. 2017) ou par criblage à haut débit. L’identification de mono-aminopyrimidines (Blondel S et al Cell Death Dis 2016) ou de rétinoïdes (Lo Cicero A, et al Sci Rep 2016) en témoignent.

Depuis 2018, nous collaborons avec les équipes de Nicolas Lévy, Antoine Muchir, Claudia Cavadas et Lino Ferreira pour étudier le vieillissement vasculaire (Ribas J, et al, Small 2017 ; Estronca L et al, ACS Biomater Sci Eng. 2018), identifier de nouvelles options thérapeutiques les régulateurs de la MMP13 (Pitrez PR et al, Nat Commun. 2020) ou le métabolisme du NAD (Cardoso et al, soumis).

Plus récemment, nous avons lancé une approche innovante basée sur l’IA visant la progérine avec l’utilisation de PROTAC en collaboration avec la société belge Kantify.

 

En collaboration avec le groupe d’Isabelle Richard à Généthon, nous avons étendu nos recherches aux dystrophies musculaires des ceintures (Limb-Girdle Muscular Dystrophies, LGMDs), caractérisées par une atteinte des muscles des hanches et des épaules, une dégénérescence musculaire progressive, ainsi qu’une fibrose et une inflammation exacerbées.

Dans notre équipe, nous utilisons des cellules musculaires dérivées de cellules souches pluripotentes induites (iPS) pour modéliser les LGMDs. Nous avons démontré que ces modèles reproduisent des caractéristiques clés de différentes LGMDs (Bruge et al. 2022) et constituent une ressource robuste pour explorer leurs mécanismes moléculaires. Nous exploitons ensuite ces modèles pour identifier des traitements pharmacologiques, grâce à des approches de criblage à haut débit et de repositionnement de médicaments (Hoch et al. 2019 Scientific Reports ; Hoch et al. 2022 Frontiers in Pharmacology).

Parmi le large spectre des LGMDs, nous avons un intérêt particulier pour la LGMD R2 (dysferlinopathie). Mené par Céline Bruge, ce programme s’appuie sur des cellules iPS dérivées de patients pour mieux comprendre les mécanismes impliqués dans l’atteinte musculaire et identifier des traitements pharmacologiques efficaces. Ces travaux ont récemment mis en évidence la possibilité de repositionner le Bazédoxifène comme approche thérapeutique (Bruge et al. 2025 British Journal of Pharmacology).

Parallèlement, il est aujourd’hui établi que certains patients atteints de dysferlinopathies présentent une évolution plus lente et une apparition plus tardive des symptômes. Ces différences suggèrent l’existence de mécanismes de compensation. Pour les identifier, nous analysons actuellement des biopsies musculaires de patients à différents, à l’aide d’approches omiques, afin de mettre en évidence des mécanismes protecteurs et d’ouvrir de nouvelles pistes thérapeutiques. Ce projet est en cours.

Enfin, nos travaux récents ont identifié DAB2 comme un biomarqueur de la LGMDR2 (Bruge et al. 2026 JCI Insight). Au-delà de son intérêt pour le diagnostic et le suivi, nos résultats suggèrent que DAB2 pourrait aussi contribuer à la physiopathologie. DAB2 est par ailleurs dérégulé dans plusieurs autres dystrophies musculaires, révélant des mécanismes communs à ces pathologies. Cette découverte nous permet désormais d’explorer des voies moléculaires partagées, avec pour objectif d’identifier une molécule thérapeutique applicable à plusieurs dystrophies musculaires.

 

Les Glycogénoses (GSDs) sont des maladies autosomiques récessives rares causées par des mutations dans les gènes codant pour des enzymes individuelles de la voie du métabolisme du glycogène. Parmi elles, la glycogénose de type III (GSDIII ; incidence : 1/100 000) est causée par des mutations du gène AGL codant pour l’enzyme débranchante du glycogène (GDE) et entraîne l’accumulation de glycogène cytosolique dans l’ensemble de l’organisme. Bien que la GDE soit exprimée dans tous les tissus, les manifestations cliniques de la maladie sont principalement dues à son absence dans le foie et les muscles. Pendant l’enfance, la maladie est principalement métabolique, avec une hépatomégalie et une hypoglycémie sévère à jeun. À l’âge adulte, la maladie métabolique devient moins importante et une faiblesse musculaire généralisée apparaît. À ce jour, il n’existe aucun traitement pour le GSDIII. Les patients suivent un régime alimentaire strict pour éviter les hypoglycémies récurrentes.

Démarré en 2020 en collaboration avec le groupe de Giuseppe Ronzitti à Généthon, ce programme a récemment été récompensé par une ANR JCJC, une subvention de la Fondation Maladies Rares et le soutien de l’Association Francophone des Glycogénoses. Mené par Lucile Hoch, ce programme vise à utiliser des cellules souches pluripotentes dérivées de patients pour comprendre les mécanismes moléculaires impliqués dans la physiopathologie musculaire de la maladie et identifier un traitement pharmacologique efficace pour éliminer l’accumulation de glycogène dans les muscles.

 

DREAMS Consortium :

Le projet DREAMS est un consortium européen monté dans le cadre d’un Appel d’offre H2020 dont l’objectif est de repositionner des médicaments pour des dystrophies musculaires par l’utilisation croisée des cellules souches pluripotentes et de l’intelligence artificielle. Coordonné par Xavier NISSAN ce consortium est composé de 9 partenaires.
1 – Xavier Nissan (CECS) Coordinateur
2 – Nik Subramanian, Segolene Martin (KANTIFY) co-coordinateur
3 – Lino Ferreira (CNC)
4 – Stephane Vassilopoulos et Antoine Muchir (Institut de myologie)
5 – Karim Whabi et Teresinha Evangelista (APHP)
6 – Shenhav Cohen (TECHNION)
7 – John Blackwood Peter Hamley (SAMSARA)
8 – Alexandre Mejat (AFM-Téléthon)
9 – ZABALA

Équipe

Xavier NISSAN

Chercheur, Resp. d’Equipe

Arrivé en 2005, Xavier développe des approches pharmacologiques pour le traitement de maladies génétiques. Son expertise est centrée sur la mise en place de modèles précliniques et le développement de criblages pharmacologiques.

Lucile HOCH

Chercheur associée

Lauréate d’une ANR JCJC, Lucile mène des recherches sur la GSDIII. Elle développe principalement des approches pharmacologiques visant à normaliser le contenu en glycogène de cellules musculaires.

Céline BRUGE

Chercheur associée

Depuis son arrivée à I-Stem en 2016, Céline s’intéresse aux dysferlinopathies. Ses recherches visent à identifier de nouveaux biomarqueurs et à identifier des agents pharmacologiques capables de les réguler.

Quentin Miagoux

Ingénieur de recherche en Bio-Informatique

Bio-informaticien de formation, Quentin s’intéresse à l’analyse de données « omics » et de criblage. Dans le cadre d’un partenariat avec Kantify, il cherche à utiliser l’IA pour identifier de nouvelles cibles thérapeutiques aux maladies génétiques. Quentin est titulaire d’un Doctorat – Sciences de la vie de de la Santé / BioInformatique.

Manon BENABIDES

Assistante de recherche

Manon travaille sur la pathologie LGMD R9. Elle recherche des traitements à cette maladie par des approches de modélisation et de criblage phénotypique. Elle occupe également la position de lab-manager de l’équipe. Manon est titulaire d’un Master Science du Vivant, Spécialité biotechnologie, génie cellulaire.

Emilie PELLIER

Assistante de recherche

Emilie travaille sur les conséquences physiopathologiques causées par l’absence de dysferline dans de la LGMD R2. Elle s’intéresse plus particulièrement à la capacité de réparation membranaire des cellules musculaires. Emilie est titulaire d’un Master – Bio-Santé / Biothérapies tissulaires, cellulaires et géniques (BTCG).

Matthieu Lejars

Assistant de Recherche (CECS)

Titulaire d’un Master en Immunologie Translationnelle et Biothérapies, Matthieu a rejoint l’équipe en novembre 2023 pour intégrer le projet DREAMS. Il est impliqué dans le développement des cellules souches pluripotentes d’intérêt, ainsi que leur différenciation en progéniteurs musculaires.

Juliette Lemoine

Chercheuse Associée

Juliette, titulaire d’un doctorat en sciences de la vie et spécialisé en thérapie génique, a rejoint l’équipe en septembre 2025 en tant que post-doctorante pour contribuer au projet DREAMS. Elle participe à la mise en place d’un criblage à haut débit basé sur l’autophagie et concentre ses travaux sur la maladie de Danon.

Hassan Hayat

Doctorant

Pharmacien de formation, titulaire d’un Master Médicaments et Produits de Santé spécialisé en thérapies innovantes, Hassan a rejoint l’équipe en février 2025 en tant que stagiaire au sein du projet DREAMS. Lauréat d’une bourse de l’École doctorale SDSV (Université Paris-Saclay), il a débuté sa thèse en octobre 2025, avec pour objectif d’identifier des hubs régulateurs communs aux dystrophies musculaires grâce à une approche multi-omique.

Collaborations

Isabelle Richard
Genethon
Giuseppe Ronzitti
Genethon
Stephane Vassilopoulos
Institut de myologie
Antoine Muchir
Institut de Myologie
Nik Subramanian, Segolene Martin, Nicolas Maignan
Kantify
Lino Ferreira
CNC
Claudia Cavadas
Coimbra university
Tanya Stojkovic
APHP
Saverio Tedesco
University College London
Sara Benedetti
University College London
Shenhav Cohen
Technion
Vicente Andres
CNIC
Anna Kajaste-Rudnitski
UNIPV

Publications

DAB2 in LGMD R2: a molecular link between disease progression and lipid dysregulation.

23 mars 2026

Bruge Celine,

Bourg Nathalie,

Pellier Emilie,

Miagoux Quentin,

Benabides Manon,

Grossi Noella,

Hayat Hassan,

Jarrige Margot,

Polveche Helene,

Agostini Valeria,

Brureau Anthony,

Vassilopoulos Stephane,

Evangelista Teresinha,

Fernández-Eulate Gorka,

Stojkovic Tanya,

Richard Isabelle,

Nissan Xavier,

JCI insight

Basket trials in rare diseases: a systematic review of current practices, methodological challenges, and future directions.

12 novembre 2025

Khazen Wael,

Corriol-Rohou Solange,

Evangelista Teresinha,

Valent Arnaud,

Abbas Sarah,

Nissan Xavier,

Mejat Alexandre,

Orphanet journal of rare diseases

Generation and characterization of three human induced pluripotent stem cell lines from patients with glycogen storage disease type II.

01 octobre 2025

Lejars Matthieu,

Kabore Christelle,

Marande Benjamin,

Brulle-Soumare Laura,

Lallouche Nejette,

Wahbi Karim,

Malfatti Edoardo,

Evangelista Teresinha,

Kassar Lina El,

Fragner Pascal,

Giraud-Triboult Karine,

Hoch Lucile,

Nissan Xavier,

Miagoux Quentin,

Stem cell research

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